TSRI在基础生物科学的研究领域一直处于世界领先水平，其研究的基础生物科学是医学研究中至关重要的一部分，它主要是探寻生命中最根本的进程。在过去30余年的时间里，TSRI研究所为人类卫生健康状况的改善作出了重大贡献。2002年TSRI将其研究生学院命名为凯洛格科学技术学校，授予学生博士学位。斯克里普斯研究学院设有以下研究项目，包括肿瘤生物学、细胞生物学、化学生理学、化学、神经成瘾性疾病、遗传学、免疫学与微生物学、病原学、代谢与衰老学、分子生物学、分子和实验医学、分子和综合性神经科学、分子治疗学、神经生物学、神经系统科学等。TSRI研究所拥有多个研究中心和项目，包括综合性分子生物学中心哈罗德多里斯(Harold L.Dorris)神经研究所，海伦多里斯(Helen L.Dorris)儿童及青少年精神疾病研究所，儿童期疾病和慢性病研究所，分子隔离中心，国际艾滋病疫苗研究机构(IAVI)设在TSRI的中和抗体中心，皮尔森酒精成瘾研究中心，斯克利普斯应用科学研究所，斯卡格化学生物学研究所，医学蠕虫研究所等。根据美国新闻与世界报道在2007年进行的排名，斯克里普斯研究学院在美国最好的生物科学研究院中排名第7位，在最好的化学研究院中排名第6位。