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斯克里普斯研究所成立于1924年，是美国最大的私立非营利性生物医学研究机构，基础生物科学的研究领域一直处于世界领先水平，其研究的基础生物科学是医学研究中至关重要的一部分，它主要是探寻生命中最根本的进程。在短短的三个十年，研究所建立了长期的跟踪记录了，并为改善人类的卫生状况作出了重大贡献。
斯克里普斯研究所基础研究含盖免疫学，分子和细胞生物学，化学，神经科学，自身免疫性疾病，心血管病学，病毒学和合成疫苗的发展。TSRI在这些学科领域的研究均获得国际上的公认，其中以在生物分子的基本机构和设计方式的研究方面表现尤为突出，是少数几个世界领先的中心之一。根据美国新闻与世界报道在2007年进行的排名，斯克里普斯研究学院在美国最好的生物科学研究院中排名第7位，在最好的化学研究院中排名第6位。
斯克里普斯研究所拥有多个研究中心和项目，包括综合性分子生物学中心（CIMBio），哈罗德·多里斯（Harold L. Dorris）神经研究所，海伦·多里斯（Helen L. Dorris）儿童及青少年精神疾病研究所，儿童期疾病和慢性病研究所，分子隔离中心，国际艾滋病疫苗研究机构（IAVI）设在TSRI的中和抗体中心，皮尔森（Pearson）酒精成瘾研究中心，斯克利普斯应用科学研究所，斯卡格（The Skaggs）化学生物学研究所，医学蠕虫研究所（WIRM）等。
斯克里普斯研究所强调建立基本的认识，在生物科学领域，为应用的医疗和物资的发现；追求基本的科学进步，通过跨学科的项目和合作，以及教育和培训研究人员准备，以满足科技革命的挑战对下一世纪。